龙文区位于北纬24°29′—24°42′，东经117°29′—117°43′。区境地质发育经历地槽、准台地及太平洋边缘活动带3个阶段，最后形成现代大陆轮廓。地貌发育在8000万年至200万年形成现今高低丘陵、九龙江河谷平原雏形。距今3.5万年发生多次海进海退，其中8000—2500年的海进，海水进抵漳州西洋坪以西地段；距今2500年，海水东退，陆地延伸，漳州平原成陆。隋唐时期，大体形成今区境地貌。

区境主要自然灾害有洪、风、旱、地震等。